Metagenomikai webszerver indult

A TTK Matematikai Intézet PIT (Protein Iformation Technology) Csoportjának tagjai beindították a mindenki számára ingyenesen elérhető AmphoraNet webszervert, amely teljesen automatikusan, rövid DNS rész-szekvenciákból képes a mintákban levő baktérium- és archaea fajok azonosítására.

Az ELTE TTK Matematikai Intézete PIT Csoportjának tagjai, Kerepesi Csaba és Bánky Dániel Grolmusz Vince professzor vezetésével beindították a – Wu és Scott Amphora2 programcsomagjára alapuló – AmphoraNet webszervert, amely teljesen automatikusan, rövid DNS rész-szekvenciákból képes a mintákban levő baktérium- és archaea fajok azonosítására. A DNS szekvenciákat az általánosan használt FASTA formátumban kell feltölteni, és egy-két óra múlva a fajok azonosítása több tucat marker-gén segítségével meg is történik. A szolgáltatás mindenki számára ingyenesen és regisztráció nélkül elérhető ezen a honlapon

ELTE

2013.02.21.